Ubicado en Cerro Molina, el museo cuenta con un paisaje expléndido. Uno de los mejores "balcones" de Cuenca.

A través de este Museo de Paleontología podemos recorrer de forma didáctica y divertida esta “Tierra de dinosaurios” y conocer directamente ejemplares tan curiosos y únicos como el basicráneo (región que alberga el cerebro) de un saurópodo titanosaurio, el Iberomesornis romerali, un ave primitiva del tamaño de un gorrión; el Concavenator corcovatus, un dinosaurio carnívoro, que vivió a principios del período Cretácico, hace aproximadamente 125 millones de años, conocido como “Pepito”. O el Lohuecotitan pandafilandi, un saurópodo gigante del yacimiento de Lo Hueco.

El patrimonio paleontológico de Castilla- La Mancha se extiende por todo el territorio castellano-manchego, existiendo una buena muestra de éste en el Museo de Paleontología de CLM. Además, en la provincia de Cuenca existen dos de los yacimientos paleontológicos más importantes del Cretácico de Europa Occidental: Las Hoyas y Lo Hueco. Conviene resaltar la alta calidad de los fósiles que en este museo se muestran, muchos de ellos únicos y con excepcional estado de preservación.